Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms