Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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VarsQ9Z1Q9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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VarsQ9Z1Q9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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VarsQ9Z1Q9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VarsQ9Z1Q9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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