Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms