Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms