Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms