Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gde1Q9JL56 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms