Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms