Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ap3m1Q9JKC8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms