Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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