Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ube3bQ9ES34 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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