Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms