Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms