Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms