Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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