Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms