Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc6Q9D4E6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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