Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms