Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms