Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Trappc6bQ9D289 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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