Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Spns3Q9D232 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Spns3Q9D232 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spns3Q9D232 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms