Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2cQ9D1C1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms