Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms