Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms