Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RpainQ9CWY9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RpainQ9CWY9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RpainQ9CWY9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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RpainQ9CWY9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RpainQ9CWY9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RpainQ9CWY9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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