Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms