Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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