Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrrc18Q9CQ07 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrc18Q9CQ07 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms