Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms