Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atoh8Q99NA2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms