Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms