Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms