Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nus1Q99LJ8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms