Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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SmagpQ99KC7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SmagpQ99KC7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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