Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms