Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms