Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms