Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Sf3b5Q923D4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf3b5Q923D4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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