Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim59Q922Y2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim59Q922Y2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms