Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip1Q922J3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms