Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc3Q91W40 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms