Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rprd1aQ8VDS4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rprd1aQ8VDS4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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