Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Fam20bQ8VCS3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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