Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms