Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms