Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumf1Q8R0F3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumf1Q8R0F3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms