Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trpt1Q8K3A2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Trpt1Q8K3A2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Trpt1Q8K3A2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Trpt1Q8K3A2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Trpt1Q8K3A2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trpt1Q8K3A2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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