Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Commd9Q8K2Q0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Commd9Q8K2Q0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd9Q8K2Q0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms