Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms