Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms