Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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